С 1999 года на базе госпиталя действует международный центр по проблемам пожилых людей «Здоровое долголетие». Он совмещает функции организационно-методического и лечебно-диагностического центров, осуществляет сотрудничество с Ярославским государственным медицинским университетом, ТФОМС, общественными организациями и различными ведомствами.
В госпитале постоянно проходит модернизация амбулаторной службы с открытием новых структурных подразделений. Так, в 2003 году был открыт областной центр профилактики остеопороза. Спустя год создан областной кардиологический центр по профилактике и лечению артериальной гипертензии. В 2006 году начало работу консультативно-поликлиническое отделение.
С 2010 года на базе госпиталя функционирует региональный центр здоровья. Его сотрудники принимают участие в проекте «Здоровая Ярославия». Организована выездная работа специалистов в районы области с целью обследования здоровых граждан для раннего выявления хронических неинфекционных заболеваний и факторов риска их развития.
Отделение травматологии-ортопедии открылось в 2010 году одновременно с центром эндопротезирования. Ежегодно здесь проводится около 1500 операций по эндопротезированию суставов и артропластике в рамках оказания ВМП и на платной основе. Всего за прошлый год в госпитале получили лечение 6195 человек, прооперирован 2681 пациент.
Отделение реабилитации по профилю «Травматология и ортопедия» успешно функционирует с 2014 года. В марте 2018 года количество коек увеличено до 25.
«Качественное оказание медицинской помощи в соответствии со стандартами и клиническими рекомендациями невозможно без совершенствования материально-технической базы, — отмечает главный врач госпиталя Михаил Осипов. — Ее улучшение — неотъемлемая часть развития учреждения. В рамках программы модернизации здравоохранения 2011-2012 гг., а также благодаря использованию средств иных источников финансирования проведен капремонт помещений госпиталя и приобретено оборудование. Но не все вопросы решены. Необходимо обновление диагностического оборудования кардиологического центра. Первоочередная наша задача — приобретение суточных мониторов ЭКГ для раннего выявления тяжелых нарушений ритма сердца и ультразвукового аппарата экспертного класса для исследования состояния сердца. Это позволит повысить качество исследований сердечно-сосудистой системы ветеранов и обеспечить 100-процентную доступность».