Больница является республиканским центром инфекционной патологии и оказывает специализированную медицинскую помощь жителям республики с различными инфекционными заболеваниями. Ежегодно ее специалисты оказывают экстренную и плановую специализированную медпомощь более чем 20 тыс. больным. Любой пациент всегда может рассчитывать на получение своевременной, эффективной и высококвалифицированной помощи.
Сегодня в составе больницы функционируют 12 клинических отделений на 510 коек (240 детских и 270 взрослых инфекционных коек) и четыре параклинических отделения: консультативно-диагностическое и физиотерапевтическое отделения, клинико-диагностическая лаборатория, аптека. Клинические отделения делятся по профилям: детские и взрослые кишечные отделения, детские и взрослые диагностические отделения, отделение вирусных гепатитов, два отделения для капельных инфекций по восемь боксов каждый, отделение реанимации и интенсивной терапии. В учреждении работают 403 сотрудника, из них 67 врачей, семь из которых удостоены звания «Заслуженный врач РБ», «Отличник здравоохранения РБ» — 10 врачей и «Отличник здравоохранения РФ» — четыре врача. Также инфекционная больница № 4 является учебной базой кафедры инфекционных болезней БашГМУ. Медучреждение активно развивается в плане оказания специализированной медицинской помощи инфекционным больным. Недавно был открыт гепатологический центр, диагностическое отделение снабжено всем необходимым оборудованием, в том числе и аппаратом «Фиброскан».

«Все наши отделения оснащены на должном уровне. В 2012 году по нацпроекту «Здоровье» аппаратура в учреждении была обновлена на 30 млн рублей. В лаборатории появились два ПЦР-аппарата, что позволило улучшить выявляемость инфекционных заболеваний, которые до этого не диагностировались. Была приобретена аппаратура УЗИ экспертного класса», — делится главный врач больницы Радик Галимов. Для подтверждения эффективности оказываемой здесь помощи достаточно сказать о том, что во время недавней эпидемии H1N1 в больницу поступало множество тяжелобольных, но ни одного летального случая так и не было отмечено. В Башкирии нередки вспышки природно-очаговых заболеваний, одно из которых — геморрагическая лихорадка с почечным синдром. Кафедра БашГМУ совместно с сотрудниками больницы уже
много лет занимается ее исследованиями. Самыми же распространенными инфекциями как в Российской Федерации, так и в Республике Башкортостан являются острые респираторные вирусные инфекции и острые кишечные инфекции. Среди пациентов больше детей. Поэтому в ближайших планах руководства — улучшение качества оказания медпомощи детям и строительство нового детского корпуса на 150 коек, проект которого уже готов и прошел экспертизу. Помимо этого здесь намерены укреплять материально-техническую базу учреждения, развиваться в плане диагностики вирусных гепатитов и совершенствовать высокотехнологичную медицинскую помощь, тесно сотрудничать с университетом для обеспечения кадрового потенциала и изучения новых инфекций.