В сентябре 1949 года решением Крайиспол-кома заведующему Крайздравотделом и краевому психоневрологу было поручено «...немедленно приступить к расширению коечного фонда Ставропольской психбольницы № 1. Предложить начальнику Крайводхоза Бородавченко незамедлительно передать психбольнице для увеличения коечного фонда бывший 6-й стройучасток «Ставропольстроя» в поселке Тоннельном Невинномысского района». 15 мая 1950 года было открыто 4-е отделение психбольницы на бывшем 6-м стройучастке «Ставропольстроя» на 100 коек. Эта дата и считается днем основания больницы.

Сегодня ГБУЗ СК «Краевая специализированная психиатрическая больница № 2» оказывает специализированную помощь взрослому населению нескольких районов и городов Ставропольского края — всего около 500 тыс. человек. Мощность больницы — 510 коек круглосуточного пребывания.

Отличает учреждение то, что его специалисты, помимо фармакотерапии, активно используют в лечении пациентов психореабилитационные методики. Так, проводятся психообразовательные тренинги для стимуляции активной позиции пациента в преодолении психического заболевания и повышении социальных компетенций. С 2013 года работает творческий клуб «Улыбка», деятельность которого направлена на реабилитацию путем творческого самовыражения. В 2014-м этот клуб принимал участие в московском фестивале для людей с особенностями психического развития «Нить Ариадны», в рамках которого  был дан спектакль на сцене Московского академического художественного лицея. 
Для профилактики рецидивов, улучшения социальной адаптации активно используется мультисемейная групповая психотерапия. Регулярно проводятся общеоздоровительные и спортивные мероприятия, работает православный клуб.
«С целью оценки климата в лечебных отделениях, выявления возможных конфликтов и оценки качества пребывания и лечения проводятся собрания сообщества в отделениях и регулярное анонимное анкетирование пациентов. Так мы стараемся создать максимально комфортные условия лечебного процесса», — рассказал главный врач учреждения Виталий Федотов.