Институт образован в результате реорганизации Ростовского городского бактериологического института и Ростовской Краевой противочумной станции в октябре 1934 года. О богатой истории учреждения и дне сегодняшнем редакции рассказала директор института Светлана Титова.
В годы ВОВ специалисты института обеспечивали эпидемиологическое благополучие в войсках южного и других фронтов, в прифронтовой полосе и на освобожденных от оккупантов территориях, ликвидировали эпидемии холеры, брюшного тифа, чумы. После войны усилия были направлены на диагностику, лечение и профилактику туляремии, холеры, позже на изучение Крымской геморрагической лихорадки, лихорадки Западного Нила и других арбовирусных инфекций.
Для быстрого реагирования в случае чрезвычайных ситуаций институт впервые предложил идею создания специализированных мобильных противоэпидемических бригад. С 1965 года сотрудники института осуществили более 60 выездов в различные регионы СССР и России, принимали участие в ликвидации вспышек заболеваний чумы и холеры в Китае, Монголии, Пакистане, Афганистане, Вьетнаме, Сомали, Индии.
В наши дни ведется работа по совершенствованию методов диагностики и профилактики холеры, чумы и других инфекционных болезней в рамках референс-центра по мониторингу холеры и центра индикации возбудителей инфекционных болезней во взаимодействии с учреждениями Роспотребнадзора и Министерства здравоохранения. Сотрудники института участвуют в обеспечении санитарно-эпидемиологического благополучия в период проведения массовых мероприятий с международным участием.
Результаты 85-летней научной деятельности института отражены в более чем 8,5 тысячи опубликованных научных работ. Разработано большое количество методов лабораторной диагностики, диагностических препаратов, инструктивно-методических и информационно-методических документов федерального и регионального уровней, патентов, баз данных и ГИС, защищено более 50 докторских и 240 кандидатских диссертаций.
В последние годы Федеральной службой Роспотребнадзора выделяются значительные средства на укрепление материально-технической базы института, благодаря чему закуплено новейшее оборудование. Это значительно расширило арсенал методов диагностики и изучения возбудителей инфекционных болезней, научные разработки пополнились современными достижениями, которые определяют перспективы и формируют новые научные направления в институте.