Ежедневно в центре осуществляется более 100 диагностических и лечебных методик и консультативный прием по 14 специальностям. За последние пять лет освоили 86 новых методик. В регистратуре работает 4 окна записи и регистрации, платные услуги регистрируют в отдельном окне. Записаться на прием или исследование можно по телефону, в регистратуре, на официальном сайте КДЦ и по электронной записи. С 2016 г. прием осуществляется только по направлениям из медорганизаций города и районов области. В консультативно-диагностическом отделении принимают специалисты 14 профилей: аллерголог-иммунолог, педиатр, терапевт, офтальмолог, хирург, кардиолог, оториноларинголог, акушер-гинеколог, уролог, эндокринолог, гастроэнтеролог, ревматолог, невролог, пульмонолог. Все специалисты имеют сертификаты и повышают профессиональный уровень. Рентгеновское отделение оснащено современным маммографом и рентгеновским аппаратом. Отделение ультразвуковой диагностики оказывает помощь по всем методикам ультразвуковых исследований. Все врачи отделения УЗ диагностики имеют высшие квалификационные категории и стаж работы более 25 лет.
Также в КДЦ работают отделения функциональной и эндоскопической диагностики, физкабинет и кабинет массажа. Кабинет охраны зрения детей открыт в феврале 2015 года. Клинико-диагностическая лаборатория оснащена оборудованием экспертного класса, здесь работает высококвалифицированный персонал. Виды выполняемых исследований — гематологические, общеклинические, биохимические, коагулологические, цитологические, иммунологические, молекулярно-биологические. Степень достоверности проводимых лабораторных исследований высока, а их спектр не имеет аналогов в городе. С 2017 года лаборатория осуществляет централизацию лабораторных исследований амбулаторно-поликлинического звена г. Таганрога. Тогда же внедрена в работу лабораторная информационная система (ЛИС).