В структуру больницы входят поликлиника на 500 посещений в смену, 16 отделений, развернутая диагностическая служба, действует стационар на 793 койки. С 2010 г. больницу возглавляет Андрей Глазырин, заслуженный врач РМЭ. Благодаря современному оборудованию специалисты успешно внедряют в практику прогрессивные операционные методики ВМП с приоритетом на малоинвазивные эндоскопические вмешательства. Щадящий режим операции и уменьшение послеоперационной реабилитации пациента — главные плюсы подобных практик. В год осуществляется около тысячи операций по направлениям урологии, нейрохирургии, травматологии, онкологии. В урологии проводится полный цикл оперативных пособий с использованием лапароскопических методик и ретроперитонеоскопического доступа.
Современные эндоурологические методы хирургического лечения проводятся с использованием тулиевого лазера. Специалисты-нейрохирурги владеют всеми видами оперативного лечения при патологиях головного и спинного мозга, связанных с онкологией, дегенеративными заболеваниями позвоночника и периферической нервной системы, травмами. Широко используется интраоперационный нейрофизиологический мониторинг, проводятся стабилизирующие операции с трансторакальным доступом. Широкое применение при хронической спинальной боли нашла радиочастотная деструкция фасеточных суставов — малоинвазивное вмешательство, способное помочь при отсутствии эффекта консервативного лечения и ЛФК. В отделении травматологии-ортопедии выполняют все виды остеосинтеза, включая погружной, интрамедуллярный, накостный. Рутинными стали операции по эндопротезированию тазобедренных и коленных суставов при дегенеративных заболеваниях и последствиях травм. Широко развита видеоартроскопия коленного и плечевого суставов, различные виды операционных вмешательств при костных и мягкотканных образованиях с применением различных видов алло- и аутопластики. РКБ получила поддержку Минздрава Марий Эл и Сколково и является единственным медучреждением в России, где реализуется пилотный проект по скринигу рака шейки матки с использованием метода жидкостной цитологии с иммуноцитохимическим исследованием. В ПАО осуществляется весь цикл морфологической диагностики — от получения операционно-биопсийного материала до определения чувствительности к таргетной терапии опухоли. Отделение урологии РКБ — клиническая база Центра обучения эндохирургии и Образовательного центра высоких технологий в медицине. Учреждение сотрудничает с медуниверситетом Йошкар-Олы, Поволжским государственным технологическим университетом, здесь располагается кафедра семейной медицины Казанского медуниверситета.