Первые упоминания о больнице в Бердске относятся еще к дореволюционному периоду. В 20-х годах ее штат состоял из полкового лекаря-австрийца, волею судеб оказавшегося в селе Бердское, старенькой акушерки, повара и санитарки. Коек было всего шесть, но за десять лет их количество увеличилось до ста. Однако по-настоящему больница начала развиваться с 1941 года, когда ее возглавил С.И. Афанасьев, ранее работавший ассистентом у академика Владимира Мыша. При Афанасьеве открылись хирургическое и родильное отделения, а также курсы медицинских сестер, позднее преобразованные в медицинское училище. Сегодня Бердская центральная городская больница — современное медицинское учреждение, включающее в себя 12 лечебно-диагностических корпусов, оснащенных новейшим оборудованием, в т. ч. компьютерным томографом, а также 3 ФАПа и врачебную амбулаторию. Коечный фонд составляет 639 единиц, 18 круглосуточных стационарных отделений, оказывающих специализированную и неотложную медицинскую помощь. Внебольничная медпомощь оказывается в отделении скорой помощи и в 8 поликлинических отделениях. На базе ЦГБ открыты и успешно работают первичное сосудистое отделение для больных с острыми нарушениями мозгового кровообращения и больных с острым коронарным синдромом, травматологический центр второго уровня для лечения пациентов, пострадавших в ДТП, межрайонный дерматовенерологический центр, которые обслуживают население Бердска, прикрепленных районов Новосибирска и Новосибирской области.
На базе Бердской ЦГБ открыт Центр здоровья для взрослых, где в течение года проводятся Школы здоровья для пациентов: для больных с артериальной гипертензией, сахарным диабетом, бронхиальной астмой, сердечной недостаточностью, ожирением, заболеваниями суставов, полости рта, Школа здорового образа жизни, борьбы с табакокурением и алкоголизмом. Уже стало традиционным проведение ежегодной акции «Розовая ленточка» по раннему выявлению онкозаболеваний молочной железы. В Бердской ЦГБ работают 1439 человек, из них 219 врачей. Для привлечения специалистов учреждение сотрудничает с Новосибирским ГМУ, где предусмотрено 16 мест для целевого обучения за счет бюджетных средств. В качестве социальной поддержки помимо гарантированных выплат врачи получают социальные выплаты, например компенсацию стоимости аренды жилья в размере 10 тыс. рублей и льготный проезд в общественном транспорте. Для поддержки молодых специалистов (врачей и среднего медицинского персонала) из фонда оплаты труда больницы выплачивается ежемесячная надбавка к заработной плате в размере 25% в течение трех лет с момента окончания учебного заведения. В соответствии с постановлением правительства Новосибирской области единовременная денежная выплата в размере 300 000 рублей предоставляется врачам, завершившим обучение в клинической интернатуре, клинической ординатуре по специальностям «терапия», «педиатрия», «акушерство и гинекология», «скорая медицинская помощь» и заключившим трудовой договор с медицинской организацией.